Witamina D reguluje gospodarkę wapniowo-fosforanową, co ma bezpośredni wpływ na gęstość mineralną kości. Zwiększa wchłanianie wapnia i fosforu, pobudza komórki kościotwórcze i reguluje mineralizację kości. Zwiększa przy tym siłę mięśni szkieletowych i skuteczność ćwiczeń fizycznych.
Niedobór u dzieci prowadzi do krzywicy i zaburzeń rozwoju zębów. U dorosłych prowadzić może do niedostatecznego wysycenia kości wapniem i osteoporozy, a co za tym idzie – podwyższonego ryzyka złamań i trudności ze zrastaniem kości.